PFKFB3是编码6-磷酸果糖-2-激酶，果糖-2，6-二磷酸酶3的基因。它是目前确定的4种组织特异性PFKFB同工酶之一（PFKFB1-4）。PFKFB3基因映射在10号染色体（10p15-p14）上的一个基因座上。它横跨一个32.5kb的区域，开放阅读框长5,675bp。PFKFB3编码的主要蛋白，iPFK2，由590个氨基酸组成。它的预测分子量为66.9 kDa，等电点为8.64。